BBC Scotland erkjenner dette, som nå angrer på at han ikke i tilstrekkelig grad utfordret en av Rowlings kritikere under en radiodebatt.
I debatten om det nye Harry Potter-spillet, Hogwarts Legacy, sa en transkvinne at hun ikke ville kjøpe spillet fordi pengene kunne gå "til å finansiere anti-transbevegelsen."
– Det har en målbar effekt på transpersoners liv og sikkerhet, og jeg tror det er derfor så mange transpersoner er opptatt av dette spillet, sier han.
Det skal blant annet programlederen ha utfordret, innrømmer BBC nå.
"Vi erkjenner at programmet ikke klarte å utfordre disse påstandene, og at deltakerne presenterte sine synspunkter som om de var fakta."
"Vi beklager," sa han.
Dette er andre gang på under en måned at BBC-gruppen har måttet beklage uimotsagte beskyldninger mot JK Rowling i forbindelse med det nye Harry Potter-spillet.
Første gang dette skjedde var 2. februar i radioprogrammet Radio 4.
En transkvinne og redaktør for et spillmagasin anklaget Rowling for «stygge synspunkter», «transfobi» og kampanjer «mot transpersoner».
Som et resultat mottok BBC ikke mindre enn 200 lytterklager og måtte be om unnskyldning for ikke å håndtere påstandene tilstrekkelig kritisk.
Rowling, som i flere tiår har vært en svært populær skikkelse rundt om i verden, har de siste årene blitt sterkt kritisert fra flere kanter for sine uttalelser om kjønn.
Hun har blant annet utfordret ideen om at kjønn skal være en konstruksjon, slik mange LHBTQ-grupper ellers mener.
Det har falt i dårlig jord for mange.
Faktisk har kritikken vært så massiv at Rowling nå adresserer den over flere episoder i en ny podcast som nettopp har blitt utgitt tirsdag på The Free Press.
Podkasten heter The Witch Trials og handler om den offentlige kritikken av forfatteren.
